ゲームシステムは歴代「サムライスピリッツ」5タイトルのアレンジと新たに天下一剣客伝オリジナルの合計6種類から選択可能！各スピリッツの特徴を生かし、闘いを有利に進めよう。

[怒スピリッツ]
（初代SAMURAI SPIRITSシステムのアレンジ）
このスピリッツの特徴は、怒ゲージがMAXになると攻撃力が大幅に上昇し、ABボタン同時押しで出る「超斬り」がある。「超斬り」はスーパーアーマー状態になる為、相手の攻撃に合わせる事でカウンターを狙える、この時スピリッツゲージがMAXだと、とんでもないダメージをたたきだせる。

[真スピリッツ]
（真SAMURAI SPIRITSシステムのアレンジ）
唯一武器破壊技が使えるスピリッツで、相手に武器を持たせない状態を長くする事ができる。スピリッツゲージがMAXになるとオリジナルの作品を思わせる怒りMAXポーズがある。「伏せ、前転、後転、下段避け」の特殊動作が行える。そして、このスピリッツだけに特別なコマンドが・・・・・！？

[斬スピリッツ]
（サムライスピリッツ斬紅郎無双剣システムのアレンジ）
自分の意思でスピリッツゲージを増加させる事が出来る唯一のスピリッツ。その他に空中ガードや武器飛ばし技もあり、体力ゲージが一定量未満になると！？「避け、回り込み」の特殊動作が行える。

[天スピリッツ]
（サムライスピリッツ天草降臨システムのアレンジ）
このスピリッツは天草降臨の連斬システムのアレンジ版を搭載し多彩な連続技が狙えるスピリッツである。その他にスピリッツゲージを使用不可の状態になるが、一発逆転を狙える「怒り爆発、一閃」が搭載されている。特殊動作としては「避け、回り込み」が行える。

[零スピリッツ]
（サムライスピリッツ零システムのアレンジ）
サムライスピリッツ零のシステムから継承された「無のゲージ」「瞑想」「無の境地」が存在する。無の境地中は相手の動きがスローモーションになり相手の隙を突く事が簡単になる（かも）。又、無の境地中には一閃も使え、一発逆転の要素もある。このスピリッツの特殊動作は「伏せ、前転、後転、下段避け、跳び込み」がある。

[剣スピリッツ]
（サムライスピリッツ天下一剣客伝オリジナルシステム）
今作品のオリジナルシステムである為、他スピリッツとは少し毛色が違っている。他スピリッツでは攻撃を受ける事によりスピリッツゲージが増加していくが、このスピリッツは攻撃する事により増加する。その他にも、ミキリスライド（相手の攻撃を特殊ボタンで避ける）、秘奥義ゲージ（ミキリスライドを成功させると増加していく）、秘奥義（体力ゲージが秘奥義ゲージ以下になると出す事ができる）、完全ガード（必殺技などの削りダメージを受けなくできる）が存在する。特殊動作は「伏せ、下段避け、スライド」